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久保田城(くぼたじょう)は、羽後国(旧出羽国)秋田郡久保田(現在の秋田県秋田市千秋公園近辺)にあった城である。
久保田藩主佐竹氏の居城である。矢留城、葛根城とも呼ばれる。土地の関係上「秋田城」と呼ばれることもあったが、古代に出羽国府が置かれた秋田城(あきたのき)とは所在地ともに別。
1880年(明治13年)の大火で城内の建造物はほぼ焼失しており、市街再建の過程で堀の多くも埋め立てられ、官庁街へと変貌した。現在、久保田城のあった一帯は千秋公園となり、県民会館や秋田市立中央図書館明徳館、平野政吉美術館などが整備されている。建造物としては、前述の大火を唯一逃れた御物頭御番所が現存し、本丸新兵具隅櫓、本丸表門が再建されている。
雄物川の支流仁別川左岸、程野村窪田にある神明山(しんめいやま、標高40m)に築かれた平山城で、石垣は基底部に僅かにあるのみでその上に土塁を盛られており、天守も持たず塁上に御出書院と呼ばれる御殿を建ててその代わりとし、8棟の櫓を建て並べていた。石垣が無いのは幕府に遠慮したためとも、石垣作りに精通した者が居なかったためとも言われるが、佐竹氏の旧領常陸国を含む東国ではもともと石垣を用いない築城法が一般的であったことも挙げられる。いずれにせよ山川沼沢を巧みに利用し防御を図っており、水堀や円郭式城郭など西国の様式も採り入れられている。
江戸時代以前、神明山には安東氏配下の三浦氏(川尻氏)が所在し、氏神を奉っていた。神明山の名もこの氏神に由来する。更に古くは、頂が3つある様から三森山・三嶽山と呼ばれていた。
1602年(慶長7年)9月17日 - 久保田藩初代藩主である佐竹義宣、安東氏の居城であった出羽湊城に入城。
1603年(慶長8年)5月 - 神明山に新城を築城開始(三浦氏の氏神は川尻村下浜へ移転)。同時に城下町と徳川家康が推進していた主要道の整備も行う。
1604年(慶長9年)8月28日 - 窪田城本丸竣工。湊城を破却し窪田城を本城と定める。また、年内に他の藩に通じる主要道が完成。
1633年(寛永10年)から1645年(正保2年)にかけて - 窪田城を久保田城と改称。
戊辰戦争では久保田藩は新政府軍を支持したため庄内藩から攻撃を受け(庄内戦争)、城下12kmまで迫られたが、仙台藩・米沢藩の降伏を受けて庄内藩が撤退したため久保田城は戦禍を免れた。